Here is a list of all functions with links to the classes they belong to:
- r -
- R() : votca::xtp::QMPair
- r() : votca::csg::BeadPair
- r12() : votca::csg::BeadTriple
- r13() : votca::csg::BeadTriple
- r23() : votca::csg::BeadTriple
- RadialIntegral() : votca::xtp::EulerMaclaurinGrid
- rand_uniform() : votca::tools::Random
- rand_uniform_int() : votca::tools::Random
- RandomlyAssignCarriertoSite() : votca::xtp::KMCCalculator
- RandomlyCreateCharges() : votca::xtp::KMCCalculator
- RangeParser() : votca::tools::RangeParser
- rank() : votca::tools::NDimVector< T, dim >
- Rate() : votca::xtp::Rate_Engine
- Rate_Engine() : votca::xtp::Rate_Engine
- RDFCalculator() : votca::csg::RDFCalculator
- read() : votca::xtp::CptTable
- ReadAngles_() : votca::csg::LAMMPSDataReader
- ReadAtoms() : votca::csg::LAMMPSDumpReader
- readAtoms() : votca::xtp::Molden
- ReadAtoms_() : votca::csg::LAMMPSDataReader
- ReadBasisSetsFromCpt() : votca::xtp::Orbitals
- ReadBonds_() : votca::csg::LAMMPSDataReader
- ReadBox() : votca::csg::H5MDTrajectoryReader, votca::csg::LAMMPSDumpReader
- ReadBox_() : votca::csg::LAMMPSDataReader
- ReadData() : votca::xtp::Atom, votca::xtp::CheckpointReader, votca::xtp::PolarSite, votca::xtp::QMAtom, votca::xtp::QMPair, votca::xtp::StaticSite
- ReadDihedrals_() : votca::csg::LAMMPSDataReader
- ReadFile() : votca::csg::XYZReader
- ReadFrame() : votca::csg::XYZReader, votca::xtp::StateSaver
- ReadFromBigMatrix() : votca::xtp::GridBox
- ReadFromBigVector() : votca::xtp::GridBox
- ReadFromCpt() : votca::xtp::AOBasis, votca::xtp::AtomContainer< T >, votca::xtp::BSE_Population, votca::xtp::DeltaQ_filter, votca::xtp::Density_filter, votca::xtp::ECPAOBasis, votca::xtp::hist< T >, votca::xtp::Localisation_filter, votca::xtp::MMRegion< T >, votca::xtp::Orbitals, votca::xtp::OscillatorStrength_filter, votca::xtp::Overlap_filter, votca::xtp::PolarRegion, votca::xtp::QMFragment< T >, votca::xtp::QMNBList, votca::xtp::QMRegion, votca::xtp::Region, votca::xtp::Segment, votca::xtp::StateFilter_base, votca::xtp::StateTracker, votca::xtp::Topology
- ReadFromHdf5() : votca::xtp::JobTopology
- readFromRow() : votca::xtp::CptTable
- ReadInducedDipolesFromLastIteration() : votca::xtp::PolarRegion
- ReadJobFile() : votca::xtp::EQM, votca::xtp::IEXCITON, votca::xtp::IQM, votca::xtp::JobCalculator, votca::xtp::QMMM
- ReadLifetimeFile() : votca::xtp::KMCLifetime
- ReadMetric() : votca::xtp::hist< T >
- readMOs() : votca::xtp::Molden
- ReadNumAtoms() : votca::csg::LAMMPSDumpReader
- ReadNumOfAngles_() : votca::csg::LAMMPSDataReader
- ReadNumOfAtoms_() : votca::csg::LAMMPSDataReader
- ReadNumOfBonds_() : votca::csg::LAMMPSDataReader
- ReadNumOfDihedrals_() : votca::csg::LAMMPSDataReader
- ReadNumOfImpropers_() : votca::csg::LAMMPSDataReader
- ReadNumTypes_() : votca::csg::LAMMPSDataReader
- ReadOccfile() : votca::xtp::VAverage
- ReadRatefile() : votca::xtp::VAverage
- ReadScalar() : votca::xtp::CheckpointReader
- ReadScalarData() : votca::csg::H5MDTrajectoryReader
- ReadScaleFactor() : votca::csg::H5MDTrajectoryReader
- ReadStaticData() : votca::csg::H5MDTrajectoryReader
- ReadTimestep() : votca::csg::LAMMPSDumpReader
- ReadTopolFile() : votca::csg::XMLTopologyReader
- ReadTopology() : votca::csg::DLPOLYTopologyReader, votca::csg::GMXTopologyReader, votca::csg::GROReader, votca::csg::LAMMPSDataReader, votca::csg::LAMMPSDumpReader, votca::csg::PDBReader, votca::csg::TopologyReader, votca::csg::XMLTopologyReader, votca::csg::XYZReader
- ReadValue() : votca::xtp::QMFragment< T >
- ReadVectorData() : votca::csg::H5MDTrajectoryReader
- Rebuild() : votca::xtp::TCMatrix_gwbse
- RebuildExclusions() : votca::csg::Topology
- RebuildName() : votca::csg::Interaction
- RecursivelyCheckOptions() : votca::tools::OptionsHandler
- Red() : votca::tools::Color< TColorScheme >, votca::tools::ColorSchemeBase
- red() : votca::tools::ColorScheme, votca::tools::csDefault, votca::tools::csRGB
- reduce() : votca::xtp::OpenMP_CUDA::CPU_data
- ReduceAndSortIndeces() : votca::xtp::StateFilter_base
- ReduceAndSortIndecesDown() : votca::xtp::StateFilter_base
- ReduceAndSortIndecesUp() : votca::xtp::StateFilter_base
- ReducedEdge() : votca::tools::ReducedEdge
- ReducedGraph() : votca::tools::ReducedGraph
- RefineElementRangeMap() : votca::xtp::EulerMaclaurinGrid
- REFormulateLinEq() : CsgREupdate
- Region() : votca::xtp::Region
- Regions() : votca::xtp::JobTopology
- Register() : votca::csg::AnalysisTool, votca::csg::StdAnalysis, votca::csg::TabulatedPotential, votca::tools::ObjectFactory< key_t, T, args_t >
- RegisterAll() : votca::xtp::Calculatorfactory, votca::xtp::FilterFactory, votca::xtp::JobCalculatorfactory, votca::xtp::QMPackageFactory, votca::xtp::QMToolFactory, votca::xtp::QuadratureFactory, votca::xtp::SigmaFactory
- RegisterBeadType() : votca::csg::Topology
- RegisterPlugins() : votca::csg::TopologyReader, votca::csg::TrajectoryReader, votca::csg::TrajectoryWriter
- ReleaseNode() : votca::xtp::Chargecarrier
- ReleaseProgFile() : votca::xtp::ProgObserver< JobContainer >
- Remove() : votca::csg::ExclusionList
- Removedfunctions() : votca::xtp::AOCoulomb, votca::xtp::AOOverlap, votca::xtp::ERIs, votca::xtp::TCMatrix
- RemoveExclusion() : votca::csg::ExclusionList
- RemoveOptional() : votca::tools::OptionsHandler
- RenameBeadType() : votca::csg::Topology
- RenameMolecules() : votca::csg::LAMMPSDataReader, votca::csg::Topology
- ReorderAtomIDs() : votca::xtp::QMMolecule
- reorderedMOCoefficients() : votca::xtp::GaussianWriter
- ReorderMOsBack() : votca::xtp::QMPackage
- reorderOperator() : votca::xtp::OrbReorder
- reorderOrbitals() : votca::xtp::OrbReorder
- ReorderOutput() : votca::xtp::QMPackage
- ReportAnalysis() : votca::xtp::Density2Gyration
- ReportJobDone() : votca::xtp::ProgObserver< JobContainer >
- ReportSummary() : votca::xtp::GWBSEEngine
- RequestNextJob() : votca::xtp::ProgObserver< JobContainer >
- res_norm() : votca::xtp::DavidsonSolver::RitzEigenPair
- Reset() : votca::tools::Color< TColorScheme >, votca::tools::ColorSchemeBase, votca::xtp::Job, votca::xtp::MMRegion< T >, votca::xtp::PolarRegion, votca::xtp::PolarSite, votca::xtp::QMRegion, votca::xtp::Region, votca::xtp::StaticRegion
- reset() : votca::tools::ColorScheme, votca::tools::csDefault, votca::tools::csRGB
- resetCarrier() : votca::xtp::Chargecarrier
- ResetForbiddenlist() : votca::xtp::KMCCalculator
- resetMatrices() : votca::xtp::IncrementalFockBuilder
- ResetRegion() : votca::xtp::StaticRegion
- reshape() : votca::xtp::CudaMatrix
- Residue() : votca::csg::Residue
- ResidueCount() : votca::csg::Topology
- Residues() : votca::csg::Topology
- resize() : votca::tools::Table
- ResolveLinks() : votca::tools::OptionsHandler
- restart() : votca::xtp::DavidsonSolver
- REUpdateLamda() : CsgREupdate
- Rotate() : votca::xtp::Atom, votca::xtp::AtomContainer< T >, votca::xtp::PolarSite, votca::xtp::QMAtom, votca::xtp::StaticSite
- rotate_W() : votca::xtp::PMLocalization
- rotateorbitals() : votca::xtp::PMLocalization
- row() : votca::xtp::CudaMatrix, votca::xtp::DipoleDipoleInteraction::InnerIterator
- rows() : votca::xtp::CudaMatrix, votca::xtp::CudaMatrixBlock< M >, votca::xtp::CudaMatrixTranspose< M >, votca::xtp::DipoleDipoleInteraction, votca::xtp::HamiltonianOperator< MatrixReplacementA, MatrixReplacementB >, votca::xtp::Mat_p_Energy, votca::xtp::MatrixFreeOperator
- RPA() : votca::xtp::RPA
- RPAInputEnergies() : votca::xtp::GW, votca::xtp::Orbitals
- Run() : CG_IMC_solve, CsgBoltzmann, CsgREupdate, pyxtp::XTPCalculators, votca::csg::CsgApplication, votca::csg::CsgApplication::Worker, votca::tools::Application, votca::tools::Thread, votca::xtp::APDFT, votca::xtp::Coupling, votca::xtp::DensityAnalysis, votca::xtp::DftGwBse, votca::xtp::Diabatization, votca::xtp::ExcitonCoupling, votca::xtp::GenCube, votca::xtp::GPUBenchmark, votca::xtp::Log2Mps, votca::xtp::Mol2Orb, votca::xtp::MolPol, votca::xtp::Orb2Fchk, votca::xtp::Orb2Mol, votca::xtp::ParallelXJobCalc< JobContainer >::JobOperator, votca::xtp::Partialcharges, votca::xtp::QMPackage, votca::xtp::QMThread, votca::xtp::QMTool, votca::xtp::Spectrum, votca::xtp::XtpApplication, VotcaProperty, XtpMap
- RunActiveDFT() : votca::xtp::Orca, votca::xtp::QMPackage, votca::xtp::XTPDFT
- RunActiveRegion() : votca::xtp::QMPackage
- RunAtomicDFT_unrestricted() : votca::xtp::DFTEngine
- RunDFT() : votca::xtp::Orca, votca::xtp::QMPackage, votca::xtp::XTPDFT
- RunVSSM() : votca::xtp::KMCCalculator, votca::xtp::KMCLifetime, votca::xtp::KMCMultiple